Скрипт обладает следующими возможностями:

1)  Архивирование, разархивирование и добавление в архив любых файлов;

2)  Удобный минималистически менеджер файлов, который решает повседневные задачи, такие как удаление, перемещение, копирование файлов, смена прав на файлы и директории;
3)  Если вы забыли/потеряли свой пароль на Joomla, то загрузив эту утилиту, вы сможете быстро поменять свой пароль;
4) Так же есть возможность загрузки удаленных файлов на ваш хост (пока только через curl);
5) Существует возможность просмотра конфигурации php на хостинге;
6) Файловый менеджер позволяет просматривать изображения лежащие вне www-директории и просматривать листинг отдельных архивов;

Он может вам пригодиться в случае, если вам не хочется копировать по фтп несколько мегабайт дистрибутива Joomla, а хочется загрузить zip файл и распаковать его прямо на хостинге. Обратно можно делать бэкап файлов, просто собрав все в один архив (можно не собирать все, а делать бэкап по частям, все зависит от настроек вашего хостинга, и если вам не хватает памяти или времени для упаковки, то можно сделать несколько архивов, вместо одного). Также скрипт может рекурсивно менять права (chmod) на файлы и директории, причем права на них задаются отдельно.

Для обеспечения безопасности (а надо понимать, что такой инструмент необходим только для разовых действий и нахождение его на хосте постоянно - большая проблема в безопасности) по умолчанию для доступа ко всем функциям скрипта необходимо ввести пароль. Сам пароль хранится в нем самом же в переменной $JSYS_PASSWORD (в самом начале файла). Если вы по каким-либо причинам захотите отключить ввод пароля, то надо переменной $JSYS_ENABLE_AUTH присвоить значение 0. Пароль по умолчанию 'joom.ru'. Перед загрузкой на хост его необходимо поменять на свой.